للمعهد مكتبة تضم عددا من المراجع العلمية الأساسية في مجال اختصاص المعهد في العقم و علاجه و التقنيات المساعدة على الأنجاب و علم الأجنة و العلوم الساندة الاخرى. و في المكتبة قاعدة للمعلومات الطبية MEDLINE تتوفر في المكتبة إمكانيات الاتصال متعدد الوسائط و ترتبط بالشبكة الدولية Internet. و يحرص المعهد على توفير الدوريات العلمية الحديثة لمواكبة التطور العلمي العالمي. لقد تأسست مكتبة المعهد مع بداية تاسيسه كمعهد في عام 1999 لتحقيق الهدف العام و هو الحصول على المصادر و المعلومات و معالجتها و تنظيمها و تأمين سهولة الوصول اليها من خلال :-
1- خدمات الأعارة لكافة أعضاء الهيئة التدريسية و الملاك الطبي و طلبة الدراسات العليا من منتسبي المعهد وغيرهم
2- أستخدام محطة الشبكة الدولية( الأنترنيت) في عمليات البحث عن المصادر العلمية أضافة الى قواعد المعلومات العالمية (Medline) مع أستخدام الحاسوب عند البحث عن قواعد المعلومات المحلية (قاعدتي الكتب و الدوريات الخاصة بمقتنيات المكتبة)
3- تزويد الأقسام العلمية بقوائم الكتب الحديثة التي تصل الى المكتبة و بصورة دورية .